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第1章 转化分析法的统计学基础1

1.1 导言1

1.2 模型与方法1

1.2.1 平衡试验设计及其统计分析模型1

1.2.2 平衡试验数据的产生2

1.2.3 非平衡试验数据的产生及统计分析2

1.2.4 试验数据的转化分析法2

1.2.5 Monte Carlo模拟数据分析结果的评价2

1.3 结果与分析3

1.3.1 五个试验中，互作项负的方差频率3

1.3.2 几个参数效益的比较3

1.3.3 转化对遗传力大小的影响6

1.4 小结8

第2章 使用本程序软件必备的M语言知识9

2.1 数组的建立及其变化操作9

2.2 矩阵的合并10

2.3 矩阵的剖分与子矩阵的合并10

2.4 稀疏矩阵及其与普通矩阵间的联系11

2.5 数组的加减乘除运算12

2.6 数组的复杂运算13

2.7 矩阵的统计分析13

2.8 矩阵与行列式间的关系15

2.9 矩阵的开方与平方运算16

2.10 M语言中的编程语句16

2.11 符号变量的计算17

2.12 符号矩阵的运算19

2.13 特定分布矩阵的产生21

2.14 精度控制与结果输出21

第3章 MLAP程序软件的内容简介和软件的使用23

3.1 程序软件MLAP研发的意义23

3.2 软件的总体设计23

3.2.1 软件的总体流程图和描述23

3.2.2 MLAP的需求信息25

3.3 本软件的功能和特点25

3.3.1 本软件的功能25

3.3.2 本软件的特点25

3.4 软件的使用25

第4章 林木遗传育种中若干试验类型的M语言程序31

4.1 单因素完全随机试验不平衡资料的分析方法31

4.1.1 单因素类内观察值不等的方差分析线性模型31

4.1.2 不平衡数据处理程序31

4.2 单因素随机区组试验数据的转化分析法32

4.2.1 求因子的离差平方和32

4.2.2 求方差分量32

4.2.3 对全同胞家系进行F检验33

4.3 两因素有众多重复次数且不平衡的方差分析程序34

4.3.1 统计模型34

4.3.2 求方差分量35

4.3.3 主效因子的显著性F检验36

4.4 三阶巢式设计非平衡试验数据的处理方法44

4.4.1 统计模型44

4.4.2 方差分析程序44

4.4.3 求期望均方系数45

4.4.4 求各因子的方差分量程序46

4.4.5 各参试因子的F检验47

4.5 平衡不平衡、规则不规则的析因设计数据的方差分析程序52

4.5.1 求因子均方52

4.5.2 求期望均方系数和方差分量54

4.5.3 主要因子的F检验56

4.6 四阶巢式设计平衡不平衡、规则不规则数据的分析程序62

4.6.1 四阶巢式设计平衡不平衡、规则不规则数据分析的统计模型62

4.6.2 四阶巢式设计平衡不平衡、规则不规则数据的分析程序62

4.6.3 自由度及均方求算65

4.6.4 求因子系数和方差分量65

4.6.5 因子的显著性F检验69

4.7 采用MINQUE（1）处理双列杂交数据73

4.7.1 矩阵模型（全双列交配设计Griffing Ⅲ）73

4.7.2 平衡不平衡、规则不规则全双交配试验数据处理程序73

4.7.3 不平衡的半双列交配设计单点试验（着重研究母本效应的大小）75

4.7.4 不平衡、不规则的半双列杂交试验数据的处理（不考虑父母效应）76

4.8 两水平杂交试验不规则、不平衡试验资料的处理程序78

4.8.1 试验简介78

4.8.2 两水平杂交试验资料的处理技术78

4.8.3 方差分析基础上的MINQUE（1）法78

4.9 遗传相关和选择指数程序80

4.9.1 同一试验设计的数据协方差分析程序80

4.9.2 方差－协方差矩阵建立86

4.9.3 相关系数的计算87

4.9.4 计算选择指数88

4.9.5 通径分析程序88

4.10 亲本育种值和子代个体育种值89

4.10.1 单点单亲家系自由授粉子代试验资料的育种值分析程序89

4.10.2 多点单亲家系自由授粉子代试验资料的亲本育种值分析程序94

4.10.3 林木全同胞子代试验资料的个体育种值95

4.11 品种稳定性分析法（几何法）107

4.11.1 多点试验的数据采集107

4.11.2 参试品种的均值、变异系数和成活率计算程序107

4.11.3 参试品种材积的稳定性分析程序110

4.11.4 参试品种木材比重的稳定性分析程序113

4.12 其他118

4.12.1 林木田间试验中多地点区试不平衡资料的分析方法118

4.12.2 关于多年度试验数据的统计处理方法118

4.12.3 林木多父本杂交不平衡试验数据的分析技术119

第5章 试验模型选择、数据采集和不平衡数据分析技巧120

5.1 单因素随机试验设计不平衡数据的方差分析法数据输入格式120

5.1.1 单因素类内观察值不等的方差分析线性模型120

5.1.2 不平衡单因素完全随机试验的典型资料120

5.2 单因素随机区组试验设计的线性模型和不平衡数据的采集格式120

5.2.1 转化后的线性模型120

5.2.2 不平衡单因素随机区组试验的典型资料121

5.3 两因素有众多重复次数且不平衡模型分析时数据采集格式122

5.3.1 不平衡数据的统计分析模型122

5.3.2 不平衡数据的典型资料122

5.4 三阶平衡不平衡巢式设计的线性模型和数据采集格式123

5.4.1 转化后的线性模型123

5.4.2 转化后的数据采集格式123

5.5 两因素随机区组设计线性模型及不平衡数据的采集格式124

5.5.1 转化后的线性模型124

5.5.2 两因素随区组试验不平衡资料的采集格式124

5.6 四阶平衡不平衡、规则不规则巢式设计的线性模型及数据采集格式125

5.6.1 转化后的线性模型125

5.6.2 转化后不平衡、不规则试验数据的采集126

5.7 林木双列杂交试验中的不平衡、规则不规则的模型与试验数据格式128

5.7.1 不平衡、规则不规则双列杂交的线性模型128

5.7.2 线性模型的矩阵表达式128

5.7.3 不平衡、规则不规则双列杂交数据格式的采集128

5.8 关于试验数据不平衡时性状间的协方差分析的数据采集129

5.8.1 单因素完全随机区组试验设计不平衡资料的协方差分析的数据采集129

5.8.2 转化后的协方差线性模型130

5.9 林木两水平杂交试验数据处理的模型选择和分析技术130

5.9.1 林木两水平杂交试验的模型选择130

5.9.2 林木两水平杂交试验数据处理的分析技术131

5.10 品种多地点区域化试验资料的分析技术132

5.11 林木遗传育种试验中非平衡试验资料的处理技术132

5.11.1 多地点的林木田间子代试验资料处理理论与技术132

5.11.2 综合数据处理的线性模型133

5.11.3 关于多年度试验数据的统计处理技术133

5.12 试验数据不平衡时性状间的遗传相关分析技术134

5.12.1 相关系数的计算134

5.12.2 单因素完全随机区组试验设计不平衡时的指数选择理论134

5.12.3 约束选择指数135

5.13 运用最佳线性预测理论评价育种值的分析技术136

5.13.1 单点单亲家系自由授粉子代试验资料的育种值分析136

5.13.2 亲本育种值的评价136

5.13.3 个体育种值的预测136

5.13.4 多点单亲家系自由授粉子代试验资料的育种值分析137

5.14 林木全同胞子代试验资料的个体育种值的估算技术137

5.14.1 林木双列杂交设计的非平衡试验资料的遗传方差分量估计137

5.14.2 林木杂交设计非平衡试验资料各因子效应的BLUP估计138

5.14.3 林木双列杂交子代林中的个体育种值估计138

5.15 多点试验不平衡数据时林木品种高产性稳定性评价技术138

5.15.1 林木品种稳定性分析的基本资料138

5.15.2 林木品种的稳定性分析——多面体的体积计算公式139

5.15.3 林木优良品种稳定性分析的步骤140

5.16 林木多父本杂交非平衡试验数据的统计分析技术140

5.16.1 田间试验和非平衡试验数据的统计分析方法和技术140

5.16.2 分组随机区组试验的非平衡资料的分析方法140

参考文献142

附录144

附录1 三阶不平衡不规则的巢式设计试验数据分析原理及M程序144

1.1 各参试因子效应的平方和144

1.2 该模型的期望方差结构144

1.3 各因子的自由度145

1.4 各因子的方差分量系数145

1.5 参试因子的方差分量和遗传力146

1.6 林分／家系／个体三水平不平衡、不规则试验数据处理M程序147

附录2 析因设计不平衡、规则不规则数据的约简模型分析法152

2.1 转化后的线性模型152

2.2 参试因子效应离差平方和的分解152

2.3 各参试因子效应的平方和153

2.4 期望均方结构153

2.5 自由度的分解155

2.6 期望均方结构156

2.7 各因子效应方差分量的求解遗传力的计算156

2.8 各因子的F检验157

2.9 主效因子的多重对比160

2.10 析因设计的约简模型的M程序161